Pentru solutionarea problemelor specifice implementarii Acordului de bază şi, de asemenea, pentru facilitarea proiectelor TRACECA, au fost create următoarele grupuri de lucru:

• Grupul de lucru TRACECA pe probleme de transport sau alte aspecte tehnice
• Grupul de lucru TRACECA pe probleme juridice
• Grupul de lucru TRACECA pe probleme financiare

Daca este necesar, pot fi create alte grupuri de lucru la cerere.